Microbiologie (bactériologie, parasitologie, mycologie)
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Microbiologie (bactériologie, parasitologie, mycologie)

Microbiologie à Tunis, Tunisie · Centre Urbain Nord

Identification des bactéries, champignons et parasites responsables d'une infection (ECBU, hémocultures, prélèvements, coprocultures) et antibiogramme pour guider le traitement.

Qu’est-ce que c’est ?

La microbiologie recherche l'agent responsable d'une infection : bactéries (bactériologie), champignons et levures (mycologie) ou parasites (parasitologie). Les prélèvements les plus courants sont l'examen cytobactériologique des urines (ECBU), les hémocultures en cas de fièvre, les prélèvements de gorge, de plaie, génitaux ou respiratoires, les coprocultures et examens parasitologiques des selles. Une fois le germe isolé en culture, le laboratoire réalise un antibiogramme : il teste la sensibilité de la bactérie aux antibiotiques pour que le médecin choisisse le traitement le plus efficace et évite les antibiotiques inutiles. Le laboratoire partenaire du Centre Médical Pasteur fonctionne jour et nuit, ce qui permet de prendre en charge sans délai les prélèvements des urgences, du bloc opératoire et des services d'hospitalisation. Les résultats de culture demandent le temps de croissance des germes, généralement de deux à trois jours ; l'examen direct est, lui, rendu rapidement.
Microbiologie (bactériologie, parasitologie, mycologie)

Quand est-il indiqué ?

Infection urinaire : ECBU

Brûlures, envies fréquentes ou fièvre : l'ECBU identifie la bactérie et l'antibiogramme indique l'antibiotique adapté.

Fièvre inexpliquée : hémocultures

Prélevées au moment des pics de fièvre, les hémocultures recherchent une bactérie dans le sang, en particulier chez les patients hospitalisés.

Angine, plaie, abcès ou infection cutanée

Le prélèvement local permet d'isoler le germe et de traiter de façon ciblée.

Troubles digestifs : coproculture et parasitologie des selles

Diarrhée persistante ou retour de voyage : la recherche de bactéries et de parasites dans les selles oriente le traitement.

Infections génitales et prélèvements vaginaux

Mycoses, vaginoses et infections sexuellement transmissibles sont diagnostiquées sur prélèvement, avec la biologie moléculaire si nécessaire.

Mycoses des ongles, de la peau ou du cuir chevelu

L'examen mycologique confirme la présence du champignon et guide un traitement souvent long.

Préparation

1Réaliser le prélèvement avant tout antibiotique ou traitement anti-infectieux local, ou au moins 48 heures après son arrêt, sauf avis du médecin
2ECBU : recueillir de préférence les premières urines du matin, après toilette intime, en milieu de jet, dans le flacon stérile fourni
3Ne pas faire de toilette de la zone à prélever au laboratoire (plaie, sécrétions)
4Apporter sans délai au laboratoire les échantillons recueillis à domicile, identifiés avec nom, prénom, date de naissance, date et heure du recueil
5Refermer hermétiquement le flacon et le placer dans un sachet fermé

Déroulement

1

Recueil ou prélèvement au laboratoire par un professionnel habilité

2

Examen direct au microscope et mise en culture sur milieux adaptés

3

Incubation puis identification du germe

4

Antibiogramme ou antifongigramme selon le germe isolé

5

Validation par le biologiste, avec commentaire d'interprétation, et transmission du résultat

Durée

Examen direct rapide ; cultures rendues en 2 à 3 jours selon le germe, plus pour certains champignons

Résultats

Le compte rendu précise le germe identifié, sa quantité et sa sensibilité aux antibiotiques. Un résultat préliminaire peut être communiqué au médecin dès l'examen direct lorsque la situation est urgente.

Risques et effets secondaires

Aucun risque lié à l'analyse elle-même
Un recueil mal réalisé peut contaminer l'échantillon et nécessiter un nouveau prélèvement

Ces risques restent rares. Votre médecin vous informera en détail avant l’examen.

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En bref

Durée : Examen direct rapide ; cultures rendues en 2 à 3 jours selon le germe, plus pour certains champignons
Préparation : Requise

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